Для борьбы с терроризмом при президенте и правительстве РФ создаётся специальный центр, в чьё прямое подчинение поступает группа «Смерч». Её костяк составляют бывшие бойцы легендарного отряда «Тайфун» — Батя, Багира, Кот и другие, перешедшие на новую службу. Исключение — Мура, которая попала в команду напрямую. Эта уникальная группа, оснащённая самым современным вооружением, объединяет не только спецназовцев, но и лучших учёных, программистов и психологов. Поставленные задачи «Смерч» выполняет в любых условиях, а его указаниям обязаны подчиняться все силовые структуры страны.