В середине XVI века Япония погружена в хаос бесконечной гражданской войны. Ни одна из враждующих сторон не может добиться решающего перевеса силой обычных армий. Тогда в ход идёт самое грозное оружие — тайные кланы ниндзя, «воинов тени», безраздельно преданные своим господам. Эти хладнокровные убийцы и неуловимые шпионы, владеющие мистическими техниками ниндзюцу и невероятным оружием, выполняют любые приказы, не ведая сомнений. Они — всего лишь безмолвное орудие в руках хозяина. Однако юный ниндзя по прозвищу Красная Тень однажды решает пойти против этой железной воли.