В 1966 году астронавты Глен и Фуджи по заданию ООН прибывают на загадочную Планету Х. Её обитатели, вынужденные скрываться под землей из-за атак ужасного Монстра Зеро, просят о помощи. Земляне с удивлением узнают в чудовище старого врага — трёхглавого Кинга Гидору. На помощь вызывают Годзиллу и Родана, которые успешно расправляются с угрозой. Однако вскоре становится ясно, что у местных жителей на могучих пришельцев с Земли были совсем другие планы.