В недалёком будущем человечество вынуждено существовать в подземных колониях, известных как Лабиринты, где людям угрожают таинственные существа кайдзю. Юная гений Мэмэмпу, окончившая колледж в девять лет, своими изобретениями уже помогла обитателям подземелья, но её настоящая мечта — стать Маркером и исследовать неизведанные глубины в надежде найти новый мир для человечества. После очередной атаки кайдзю она вместе со своим отцом отправляется в опаснейшую экспедицию по Лабиринтам, и это путешествие может навсегда изменить судьбу их цивилизации.